Расшифровка генома становится все более простой и доступной процедурой. Стоимость секвенирования снижается, а сами приборы, которые используются для расшифровки, становятся более компактными.
Исследователи из Университета Ноттингема (University of Nottingham) заявили о том, что им удалось создать, пожалуй, наиболее компактный на сегодняшний день секвенатор. Прибор, получивший название MinION, помещается в карман – размеры остальных приборов для секвенирования сопоставимы с размерами офисного принтера.
Мэттью Луз (Matthew Loose), один из разработчиков прибора, объясняет, что MinION способен прочитывать последовательности длиной до 882 тысяч пар оснований, а это действительно достаточно длинные участки ДНК.
Прибор работает по принципу нанопорового секвенирования: внутри устройства находится заполненная электролитом камера, разделенная мембраной. В мембране, находящейся внутри реакционной камеры, есть пора, через которую может проходить одноцепочечная нить нуклеиновой кислоты. Камера находится под напряжением, а прохождение разных нуклеотидов сквозь пору вызывает изменение силы тока, текущего через нее – эти изменения можно зарегистрировать, определив таким образом последовательность расположения нуклеотидов в цепочке ДНК.
В настоящее время точность прибора не очень высока – MinION допускает несколько ошибок на 100 пар оснований. Прибор постоянно совершенствуется и точность секвенирования повышается, но до идеала пока далеко. Немало времени уходит и на обработку полученных данных.
Впрочем, исследователи считают свою разработку достаточно перспективной: за 1000 долларов ученые получают компактный инструмент с довольно большими возможностями. Они надеются, что в дальнейшем секвенатор станет делать меньше ошибок, а потому окажется более полезным.
Комментарии (0)